Los jugadores que juegan 'EteRNA' simplemente superan la ciencia profesional en este descubrimiento crucial

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Anonim

La ciencia ciudadana acaba de pasar al siguiente nivel: los videojugadores han hecho un descubrimiento biológico, y ahora ha sido publicado por una revista científica revisada por expertos.

Publicado esta semana en el Revista de biología molecular, una serie de reglas desarrolladas intuitivamente para determinar cuán difícil será lograr una forma particular a través del diseño de ARN. Encontraron, por ejemplo, que cuanto más simétrica es una forma, más difícil será diseñar una hebra de ARN para que coincida.

El colectivo de videojugadores hizo el descubrimiento jugando, EteRNA, un juego que desafía a los jugadores a tomar hebras de ARN y plegarlas en la forma deseada al alterar su composición química. El problema científico de doblar el ARN en una forma particular es complejo, pero el juego no lo es, no se requiere comprensión de la bioquímica para comenzar a jugar.

Los jugadores tomaron la pregunta de investigación por su propia iniciativa, como una forma de dar a los jugadores nuevos herramientas para juzgar la dificultad relativa de los diferentes rompecabezas. Los hallazgos ayudarán a guiar la investigación biomédica futura, ya que el nuevo conjunto de reglas les da a los científicos una mejor idea de si tratar de plegar el ARN en una forma dada es un ejercicio inútil.

"Esta investigación sugiere que el paradigma estándar del crowdsourcing científico puede invertirse", dice Rhiju Das, profesor de bioquímica en Stanford, Inverso en un email EteRNA fue lanzado en 2011 por Das y Adrien Treuille, profesor asistente de ciencias de la computación en la Universidad Carnegie Mellon. " EteRNA los jugadores pueden idear sus propias preguntas de investigación y pueden redactar sus propios documentos. En esta investigación, hubo una pequeña guía y pruebas independientes de expertos en mi laboratorio ".

El ARN sintetizado tiene un potencial increíble para una nueva generación de medicamentos y terapias médicas. Si se puede plegar en la forma correcta, el ARN se puede construir para atacar virus específicos, cánceres e incluso trastornos genéticos. CRISPR, un proceso de edición de genes que podría alterar dramáticamente el futuro de la existencia humana, utiliza el ARN para guiar la enzima cortadora de ADN, Cas9, a la sección no deseada del ADN.

EteRNA comenzó como un foro para científicos expertos para presentar rompecabezas a los jugadores, pero desde entonces ha crecido más allá de eso. El juego y sus 100,000 jugadores registrados ahora existen en una relación simbiótica y en evolución con científicos profesionales y modelos informáticos creados para diseñar y probar la estructura del ARN.

“Modelado por ordenador y EteRNA No son exclusivos ”, dice Das. " EteRNA reúne a mucha gente, algunos de los cuales están escribiendo sus propios modelos de computadora ".

En el documento actual, los jugadores escribieron guiones en colaboración para probar sus ideas sobre lo que hace que las estructuras de ARN sean difíciles de diseñar. Das dice que algunos jugadores le dijeron que están particularmente entusiasmados de automatizar sus ideas en modelos de computadora porque quieren continuar y resolver problemas más difíciles.

Problemas construidos por EteRNA los jugadores realmente se sintetizan en el laboratorio de Das, hasta ahora se han construido 86,459 secuencias generadas por jugadores IRL.

Los autores principales del artículo fueron EteRNA los jugadores Jeff Anderson-Lee, Eli Fisker, Vineet Kosaraju y Michelle Wu. Wu es también un Ph.D. estudiante de informática biomédica en stanford.

En el futuro, podría ser que los expertos ciudadanos comiencen a publicar descubrimientos científicos de forma completamente independiente.

“Esta plantilla de 'crowdsourcing invertido' para la ciencia ciudadana podría ser útil para otros proyectos y campos de la ciencia, como la astronomía (Galaxy Zoo) o identificación de especies de origen público (Código de barras de la vida), Dice Das. "Especialmente si ellos, como EteRNA, están viendo cuellos de botella en la etapa de escritura en papel ".

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